.DS_Store ってなに？

ウィンドウの表示位置とか表示方法とかアイコンの位置とかを管理してるファイルらしい。
なので消しても全く問題なし。

生成しない方法

http://docs.info.apple.com/article.html?artnum=301711-ja

.DS_Storeお掃除ツール

http://www.redroomdevelopment.com/products/ds_store_cleaner/

そんなの使わないで、コマンドで一括削除

find [dir] -name .DS_Store | xargs rm

もっとちゃんと書くなら

find [dir] -name .DS_Store -type f -print0 | xargs -0 rm -f